Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXQ1Q9C009 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXQ1Q9C009 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXQ1Q9C009 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXQ1Q9C009 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXQ1Q9C009 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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FOXQ1Q9C009 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXQ1Q9C009 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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