Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM6SF1Q9BZW5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms