Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX4Q9BYU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms