Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms