Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHANK3Q9BYB0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms