Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms