Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYCP2Q9BX26 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms