Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REPIN1Q9BWE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REPIN1Q9BWE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms