Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms