Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2AFJQ9BTM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2AFJQ9BTM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms