Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms