Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms