Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIKE1Q9BRV8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms