Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MESP1Q9BRJ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MESP1Q9BRJ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms