Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP2Q99959 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP2Q99959 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms