Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms