Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGRRF1Q99675 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms