Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD5Q99666 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms