Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POP1Q99575 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP1Q99575 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP1Q99575 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POP1Q99575 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP1Q99575 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POP1Q99575 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP1Q99575 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP1Q99575 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms