Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SORT1Q99523 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms