Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTCH4Q99466 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTCH4Q99466 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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