Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT12Q99456 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms