Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK5RAP2Q96SN8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms