Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3IPQ96QF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms