Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC7Q96M83 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms