Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00477Q96M19 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms