Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms