Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF496Q96IT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms