Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
APIPQ96GX9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APIPQ96GX9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms