Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
BCANQ96GW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BCANQ96GW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms