Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
STAMBPL1Q96FJ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms