Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms