Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms