Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPTNQ96CV9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms