Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms