Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC59Q96AG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms