Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF3C6Q969F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF3C6Q969F1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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