Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-CQ95604 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-CQ95604 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms