Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCC1Q92922 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCC1Q92922 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms