Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC4Q92889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC4Q92889 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms