Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC110Q8TBZ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC110Q8TBZ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms