Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF548Q8NEK5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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