Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARRDC4Q8NCT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARRDC4Q8NCT1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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