Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FSIP1Q8NA03 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FSIP1Q8NA03 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms