Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DTX3Q8N9I9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms