Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM199Q8N511 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM199Q8N511 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms