Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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