Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CA13Q8N1Q1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms