Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPUSD2Q8IZ73 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPUSD2Q8IZ73 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms