Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD302Q8IX05 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms